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          UDP糖|從分子模型的角度研究人類udp -糖基轉(zhuǎn)移酶(UGT)的udp -糖選擇性
          發(fā)布時(shí)間:2022-02-22     作者:UDP糖   分享到:

          人尿苷二磷酸(UDP)-糖基轉(zhuǎn)移酶(UGT)超家族的酶通常催化從UDP-糖輔因子到相對(duì)小的親脂化合物的糖的共價(jià)加成。


          糖偶聯(lián)物的生物活性通常較低,可提高水溶性,有助于更**地從體內(nèi)排出。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)表明,UGT蛋白對(duì)不同的udp -糖表現(xiàn)出不同的選擇性。


          雖然UGT蛋白的三維(3D)結(jié)構(gòu)需要深入了解各種UGT蛋白的udp -糖選擇性,但目前還沒有與udp -糖結(jié)合的人類UGT的實(shí)驗(yàn)結(jié)構(gòu)。


          因此,三維結(jié)構(gòu)的缺乏為在原子水平上分析udp -糖的選擇性提出了一個(gè)主要的挑戰(zhàn)。在這篇評(píng)論中,我們著重介紹了比較同源性建模在理解UGT蛋白的udp -糖選擇性方面的應(yīng)用。


          c端(CT)結(jié)構(gòu)域的同源性模型表明UGT家族具有高度保守的結(jié)構(gòu)折疊,與UGT2B7-CT x射線晶體結(jié)構(gòu)相比,其主鏈均方根偏差(rmsds)介于0.066和0.079 ?之間。


          該模型表明,CT信號(hào)序列末端的四個(gè)殘基對(duì)udp -糖的選擇性起著重要作用。n端結(jié)構(gòu)域不太可能與udp -糖的選擇性相關(guān),盡管UGT 1和2家族中的保守殘基Arg-259 (UGT2B7編號(hào))可能會(huì)影響udp -糖的選擇性?偟膩碚f,在預(yù)測(cè)影響udp -糖結(jié)合選擇性的關(guān)鍵殘基方面,該模型與實(shí)驗(yàn)觀察結(jié)果非常一致。

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