SYBR Green I 熒光染料的應(yīng)用場景和顏色是什么?
SYBR Green I 是一種常用于分子生物學(xué)中的綠色熒光核酸染料,能夠與雙鏈DNA(dsDNA)特異性結(jié)合并增強(qiáng)其熒光強(qiáng)度,常用于 實(shí)時熒光定量PCR(qPCR)、瓊脂糖凝膠電泳染色、DNA定量檢測等。
基本信息
名稱:SYBR Green I
發(fā)射顏色:綠色熒光
激發(fā)波長(Excitation):約 497 nm
發(fā)射波長(Emission):約 520 nm
熒光增強(qiáng):與dsDNA結(jié)合后熒光增強(qiáng)超過1000倍
結(jié)構(gòu):為非共價結(jié)合小分子染料,具有疏水性吡啶結(jié)構(gòu),可插入雙螺旋結(jié)構(gòu)中
應(yīng)用場景
實(shí)時熒光定量PCR(qPCR)
SYBR Green I在PCR擴(kuò)增過程中不斷與新合成的雙鏈DNA結(jié)合,從而同步監(jiān)測熒光強(qiáng)度,反映擴(kuò)增產(chǎn)物的量。
優(yōu)勢:操作簡單、價格低廉、可用于廣泛的引物對
劣勢:特異性不如TaqMan探針,因?yàn)?/span>SYBR Green無法區(qū)分特異擴(kuò)增與非特異擴(kuò)增(如引物二聚體)
瓊脂糖凝膠染色
可作為替代溴化乙錠(EB)的低毒DNA染料,熒光強(qiáng)度高,安全性更好
通常在預(yù)染或泳后染色步驟使用
DNA定量檢測
通過與標(biāo)準(zhǔn)曲線比對,可用于快速測定DNA濃度
注意事項
特異性問題:SYBR Green I 只要與雙鏈DNA結(jié)合就能發(fā)光,因此可能會對非特異產(chǎn)物(如引物二聚體)產(chǎn)生信號干擾。
高濃度抑制反應(yīng):過量的SYBR Green可能會抑制PCR反應(yīng),建議使用廠家推薦濃度(通常為1×工作濃度)。
不適用于RNA直接檢測,除非先進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。
避光保存:對光敏感,應(yīng)在避光、低溫(通常為-20°C)條件下保存。
? 優(yōu)點(diǎn)
使用方便,兼容性好
成本低于TaqMan探針類染料
與大多數(shù)qPCR平臺兼容
可廣泛用于常規(guī)PCR和電泳分析
缺點(diǎn)
對非特異性擴(kuò)增敏感
無法用于多重PCR檢測
難以區(qū)分不同片段大小的產(chǎn)物
熒光定量PCR或核酸電泳實(shí)驗(yàn),SYBR Green I 是一個常用且高效的工具。需要提高特異性時,建議結(jié)合熔解曲線分析或考慮使用特異性探針(如TaqMan)。