新型光控化學(xué)小分子交聯(lián)劑-含NHS酯基和光保護(hù)ortho-QM(o-QM)的雙功能交聯(lián)劑NHQM

小分子交聯(lián)劑對(duì)于探測(cè)生物分子間的相互作用和在處理大型蛋白復(fù)合物和內(nèi)在無序蛋白時(shí)的交聯(lián)質(zhì)譜(CXMS)是重要的�，F(xiàn)有的化學(xué)交聯(lián)劑只針對(duì)一小部分氨基酸殘基，限制了交聯(lián)的數(shù)量和類型，而傳統(tǒng)的光交聯(lián)劑幾乎不選擇性地針對(duì)所有殘基，使數(shù)據(jù)分析變得復(fù)雜。

基于光保護(hù)的喹酮甲基化(PQM)的一系列交聯(lián)劑，能夠通過特定的Michael加成靶向9個(gè)親核殘基。除了Asp、Glu、Lys、Ser、Thr和Tyr外，PQM交聯(lián)劑還**地交聯(lián)了Gln、Arg和Asn，**，這些化學(xué)交聯(lián)劑還不能作為靶點(diǎn)，用單一交聯(lián)劑**地增加了靶點(diǎn)殘基的數(shù)量。

較初設(shè)計(jì)了一種含NHS酯基和光保護(hù)ortho-QM(o-QM)的雙功能交聯(lián)劑NHQM。鄰硝基芐基在酚羥基上的鄰位甲基上連接了兩個(gè)氟原子，當(dāng)加入到蛋白中時(shí)，NHS會(huì)很快和暴露的Lys殘基反應(yīng)，將光保護(hù)的o-QM放置在相互作用蛋白的殘基旁邊，o-硝基芐基在紫外線照射下被清除，生成o-QM，并與附近的親核側(cè)鏈發(fā)生交聯(lián)。

為了增加交聯(lián)劑的靈活性，還合成了NHQM3C，在NHQM的spacer 中添加了三個(gè)亞甲基。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，NHQM和NHQM3C用小分子交聯(lián)劑將自然殘基的靶標(biāo)庫(kù)擴(kuò)大到9個(gè)親核殘基。為了使細(xì)胞內(nèi)的交聯(lián)成為可能，還設(shè)計(jì)了一個(gè)具有同功能的交聯(lián)劑HoQM，在兩端都采用了光保護(hù)的o-QM。認(rèn)為，將NHS酯替換為光保護(hù)的QM可以在光激活前消除交聯(lián)劑的化學(xué)反應(yīng)性，從而使其進(jìn)入細(xì)胞而不會(huì)引起細(xì)胞毒性。此外，兩端的QM可以增加交聯(lián)類型的多樣性，因?yàn)?/span>QM與NHS酯相比會(huì)和更多的殘基反應(yīng)。

與DNA交聯(lián)的試劑仍然很少，因?yàn)榇蠖鄶?shù)交聯(lián)劑的反應(yīng)更傾向于蛋白-蛋白而不是蛋白-DNA交聯(lián)。甲醛是主要的試劑交聯(lián)試劑，但只能和在2埃以內(nèi)的蛋白發(fā)生交聯(lián)。QM能地烷基化脫氧核苷，因此，推斷NHQM應(yīng)該能夠使蛋白質(zhì)與DNA交聯(lián)，實(shí)驗(yàn)證明的假設(shè)是正確的。

  總之，這些PQM交聯(lián)劑的光活化和多靶點(diǎn)反應(yīng)性將大大增強(qiáng)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)- DNA網(wǎng)絡(luò)研究和結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究的化學(xué)交聯(lián)基礎(chǔ)技術(shù)。

pg電子官方生物供應(yīng)：

產(chǎn)品列表：

DHB

2,5-dihydroxybenzoic acid

CAS Number: 490-79-9

CHCA

α-Cyano-4-hydroxycinnamic acid

CAS Number: 28166-41-8

HABA

2-(4'-Hydroxybenzeneazo)benzoic acid

CAS Number: 1634-82-8

Sinapinic Acid  

CAS Number: 530-59-6

THAP

2',4',6'-Trihydroxyacetophenone monohydrate

CAS Number: 480-66-0

DHAP

2',4',-Dihydroxyacetophenone

CAS Number: 89-84-9

MBT

MBT MALDI matrix, 2-Mercaptobenzothiazole

CAS Number: 149-30-4

色譜相關(guān)試劑

產(chǎn)品列表：

LCMS Grade Solvents：

LCMS Acetonitrile     CAS Number: 75-05-8

LCMS Acetonitrile with 0.1% Acetic Acid

LCMS Acetonitrile with 0.1% Formic Acid

LCMS Acetonitrile with 0.1% TFA

LCMS Acetonitrile with 0.1% Formic Acid and 0.01% TFA

LCMS Water with 0.1% Acetic Acid

LCMS Water with 0.1% Formic Acid

LCMS Methanol       CAS Number: 67-56-1

LCMS Water          CAS Number: 7732-18-5

HPLC Grade Solvents：

HPLC Acetone           CAS Number: 67-64-1

HPLC Acetonitrile        CAS Number: 75-05-8

HPLC Acetonitrile with 0.1% TFA

HPLC Cyclohexane       CAS Number: 110-82-7

HPLC Dimethyl sulfoxide  CAS Number: 67-68-5

HPLC Methanol          CAS Number: 67-56-1

HPLC Water             CAS Number: 7732-18-5

Acetic Acid Ampules (Proteomics Grade)    CAS Number: 64-19-7

Formic Acid Ampules (Proteomics Grade)    CAS Number: 64-18-6

TFA Ampules (Proteomics Grade)          CAS Number: 76-05-1

HFBA Ampules (Proteomics Grade)         CAS Number: 375-22-4

Formic Acid + TFA Ampules (Proteomics Grade)

LCMS Mobile Phases Sampler Pack

Additives & Ion Pairing：

Proteochem蛋白交聯(lián)試劑，進(jìn)口蛋白交聯(lián)試劑

Protein crosslinkers （蛋白交聯(lián)相關(guān)試劑）：

Heterobifunctional Crosslinkers異型雙功能交聯(lián)劑：

SMCC Crosslinker

Succinimidyl-4-[N-maleimidomethyl]cyclohexane-1-carboxylate

CAS Number: 64987-85-5

Sulfo-SMCC Crosslinker

Sulfosuccinimidyl-4-[N-maleimidomethyl]cyclohexane-1-carboxylate

CAS Number: 92921-24-9

Sulfo-SANPAH Crosslinker

N-Sulfosuccinimidyl-6-[4'-azido-2'-nitrophenylamino] hexanoate

CAS Number: 102568-43-4

SMPH Crosslinker

Succinimidyl-6-[?-maleimidopropionamido]hexanoate

PDPH Crosslinker

3-[2-Pyridyldithio]propionyl hydrazide) is a cleavable, carbohydrate reactive

MBS Crosslinker

m-Maleimidobenzoyl-N-hydroxysuccinimide ester

CAS Number: 58626-38-3

Sulfo-MBS Crosslinker

m-Maleimidobenzoyl-N-hydroxysulfosuccinimide ester

SPDP Crosslinker

N-Succinimidyl 3-[2-pyridyldithio]-propionate

CAS Number: 68181-17-9

LC-SPDP Crosslinker  

Succinimidyl 6-(3-[2-pyridyldithio]-propionamido)hexanoate

Sulfo-LC-SPDP Crosslinker

Sulfosuccinimidyl 6-(3'-[2-pyridyldithio]-propionamido)hexanoate

SIA Crosslinker

N-Succinimidyl iodoacetate

CAS Number: 39028-27-8

SBA Crosslinker

N-Succinimidyl bromoacetate; SIB crosslinker

CAS Number: 42014-51-7

SMPB Crosslinker

N-Succinimidyl 4-[4-maleimidophenyl]butyrate

CAS Number: 79886-55-8

BMPS Crosslinker

N-(?-Maleimidopropyloxy)succinimide ester

CAS Number: 55750-62-4

EMCS Crosslinker

N-[e-Maleimidocaproyloxy]succinimide ester

CAS Number: 55750-63-5

GMBS Crosslinker

N-[Gamma-Maleimidobutyryloxy] Succinimide

CAS Number: 80307-12-6

ANB-NOS Crosslinker

N-5-Azido-2-nitrobenzoyloxysuccinimide

CAS Number: 60117-35-3

Homobifunctional Crosslinkers同型雙功能交聯(lián)劑：

BS3 Crosslinker

Bis[sulfosuccinimidyl] suberate

CAS Number: 82436-77-9

DSS Crosslinker

Disuccinimidyl suberate   N-hydroxysuccinimide ester

CAS Number: 68528-80-3

BS2G Crosslinker

BS2G; Bis[Sulfosuccinimidyl] glutarate

DSG Crosslinker

Disuccinimidyl glutarate; Di(N-succinimidyl

CAS Number: 79642-50-5

DSP Crosslinker

3,3'-Dithiodipropionic acid di(N-hydroxysuccinimide ester)

CAS Number: 57757-57-0

DTSSP Crosslinker

3,3?-Dithiobis[sulfosuccinimidylpropionate

CAS Number: 81069-02-5

Sulfo-EGS Crosslinker

glycolbis(sulfosuccinimidylsuccinate)

CAS Number: 167410-92-6

EGS Crosslinker

Ethylene glycolbis(succinimidylsuccinate)

CAS Number: 70539-42-3

DST Crosslinker  

CAS Number: 62069-75-4

Zero-Length Crosslinkers - EDC-HCl, Sulfo-NHS & NHS：

EDC-HCl

1- Ethyl-3-[3-dimethylaminopropyl]carbodiimide hydrochloride

CAS Number: 25952-53-8

Sulfo-NHS

N-hydroxysulfosuccinimide  Hydroxy-2,5-dioxopyrrolidine-3-sulfonicacid

CAS Number: 106627-54-7

上述產(chǎn)品僅用于科研，不可用于人體實(shí)驗(yàn)！

wyf 03.26