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          液相分離(親水性和疏水性)和質(zhì)譜聯(lián)用的技術(shù)鑒定老鼠以及酵母中的同位素代謝物。
          發(fā)布時間:2020-12-14     作者:wyf   分享到:

          液相分離(親水性和疏水性)和質(zhì)譜聯(lián)用的技術(shù)鑒定老鼠以及酵母中的同位素代謝物。

          研究方向有:質(zhì)譜蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)、阿爾茨海默病的分子發(fā)病機制、泛素和蛋白質(zhì)組Turnover和**癥的系統(tǒng)生物學(xué)。

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          高通量非靶向代謝組學(xué)通常依賴于互補液相色譜-質(zhì)譜(LC-MS)方法來擴大各種代謝物的覆蓋范圍,但這些方法的集成尚無法完全表征。我們系統(tǒng)地研究了8LC-MS設(shè)置,不同固定相(HILICC18),流動相(酸性和堿性pH)下親水相互作用液相色譜(HILIC-MS和納流反相液相色譜(nRPLC-MS的性能)和MS電離模式(正負)。之前曾報道過nRPLC-MS的優(yōu)化,但我們在HILIC-MS2.1 mm×150 mm)中發(fā)現(xiàn),通過從2 mg細胞/組織樣本。由于峰特征受到污染物的高度損害,因此我們使用穩(wěn)定同位素標(biāo)記的酵母來增強配方鑒定,以比較不同的LC-MS條件。8LC-MS設(shè)置可檢測總共1050個配方,其中**組合分別為4種,3種和2LC-MS可以回收78%,73%和62%的配方。此外,在存在或不存在氮饑餓的情況下收集這些酵母樣品,從而能夠?qū)Ρ容^的配方和代謝物結(jié)構(gòu)進行定量比較,然后使用選定的合成代謝物進行驗證。

          結(jié)果表明,氮饑餓會下調(diào)氨基酸成分,但會上調(diào)尿苷相關(guān)的代謝。

          用兩種不同的液相分離(親水性和疏水性)和質(zhì)譜聯(lián)用的技術(shù),鑒定老鼠以及酵母中的同位素代謝物。設(shè)定了較佳的鑒定參數(shù),并且對正常酵母和氮饑餓的酵母樣品,進行同位素代謝組學(xué)鑒定。

          反相液相色譜法(reverse-phase liquid chromatography,RPLC)是代謝組學(xué)中較常見和實用的一種LC分離方法。但是缺點是對于強極性物質(zhì)保留較差。親水相互作用液相色譜(hydrophilic interaction liquid chromatographyHILIC)是近年來色譜領(lǐng)域研究的熱點之一。

          它通過采用強極性度固定相,并且結(jié)合高比例有機相和低比例水相作為流動相。此前文章報道的RPLCHILIC是主要集中在特征峰的數(shù)目方面,還沒有文章系統(tǒng)比較這兩種方法在代謝組學(xué)上的鑒定和分析。

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